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KEGG数据库

1 KEGG介绍 1.1 KEGG的历史和背景 1.2 KEGG的主要功能和应用领域 2 KEGG数据库概述 2.1 KEGG PATHWAY 2.2 KEGG BRITE 2.3 KEGG MODULE 2.4 KEGG DISEASE 2.5 KEGG DRUG 2.6 KEGG ENVIRON 3 KEGG PATHWAY分析 3.1 如何查询KEGG PATHWAY 3.2 如何理解KEGG PATHWAY图 3.3 如何进行KEGG PATHWAY富集分析 4 KEGG BRITE分析 4.1 如何查询KEGG BRITE 4.2 如何理解KEGG BRITE图 4.3 如何进行KEGG BRITE富集分析 5 KEGG MODULE分析 5.1 如何查询KEGG MODULE 5.2 如何理解KEGG MODULE图 5.3 如何进行KEGG MODULE富集分析 6 KEGG DISEASE分析 6.1 如何查询KEGG DISEASE 6.2 如何理解KEGG DISEASE图 6.3 如何进行KEGG DISEASE富集分析 7 KEGG DRUG分析 7.1 如何查询KEGG DRUG 7.2 如何理解KEGG DRUG图 7.3 如何进行KEGG DRUG富集分析 8 KEGG ENVIRON分析 8.1 如何查询KEGG ENVIRON 8.2 如何理解KEGG ENVIRON图 8.3 如何进行KEGG ENVIRON富集分析 9 KEGG与其他数据库的交互 9.1 如何将基因ID转换为KEGG ID 9.2 如何将KEGG ID转换为基因ID 9.3 如何将KEGG ID转换为Uniprot ID 9.4 如何将Uniprot ID转换为KEGG ID 10 KEGG在生物信息学中的应用 10.1 KEGG在基因组学中的应用 10.2 KEGG在转录组学中的应用 10.3 KEGG在蛋白质组学中的应用 10.4 KEGG在代谢组学中的应用
首页 教程 KEGG数据库 KEGG MODULE分析
KEGG MODULE分析是一种基于KEGG数据库的生物系统功能注释和预测方法。它将一系列相关基因产物(如酶、通路等)组织成一个模块,以此来描述细胞内的特定生物学过程或分子功能。 在KEGG MODULE中,每个模块都由一组相关的KEGG pathway组成,这些pathway共享相同的反应或酶。通过这种方式,MODULE可以提供一个更全面、更高层次的理解细胞功能的方式。 在进行KEGG MODULE分析时,通常会将实验数据(如基因表达数据)与MODULE中的基因集进行比较,以找出哪些MODULE在特定条件下被激活或抑制。这种分析可以帮助我们理解细胞在特定条件下的功能状态,以及可能发生的生物学过程。 总的来说,KEGG MODULE分析是一种强大的工具,可以帮助我们从基因组学数据中提取出生物学意义,从而更好地理解细胞的功能和行为。

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