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KEGG数据库

1 KEGG介绍 1.1 KEGG的历史和背景 1.2 KEGG的主要功能和应用领域 2 KEGG数据库概述 2.1 KEGG PATHWAY 2.2 KEGG BRITE 2.3 KEGG MODULE 2.4 KEGG DISEASE 2.5 KEGG DRUG 2.6 KEGG ENVIRON 3 KEGG PATHWAY分析 3.1 如何查询KEGG PATHWAY 3.2 如何理解KEGG PATHWAY图 3.3 如何进行KEGG PATHWAY富集分析 4 KEGG BRITE分析 4.1 如何查询KEGG BRITE 4.2 如何理解KEGG BRITE图 4.3 如何进行KEGG BRITE富集分析 5 KEGG MODULE分析 5.1 如何查询KEGG MODULE 5.2 如何理解KEGG MODULE图 5.3 如何进行KEGG MODULE富集分析 6 KEGG DISEASE分析 6.1 如何查询KEGG DISEASE 6.2 如何理解KEGG DISEASE图 6.3 如何进行KEGG DISEASE富集分析 7 KEGG DRUG分析 7.1 如何查询KEGG DRUG 7.2 如何理解KEGG DRUG图 7.3 如何进行KEGG DRUG富集分析 8 KEGG ENVIRON分析 8.1 如何查询KEGG ENVIRON 8.2 如何理解KEGG ENVIRON图 8.3 如何进行KEGG ENVIRON富集分析 9 KEGG与其他数据库的交互 9.1 如何将基因ID转换为KEGG ID 9.2 如何将KEGG ID转换为基因ID 9.3 如何将KEGG ID转换为Uniprot ID 9.4 如何将Uniprot ID转换为KEGG ID 10 KEGG在生物信息学中的应用 10.1 KEGG在基因组学中的应用 10.2 KEGG在转录组学中的应用 10.3 KEGG在蛋白质组学中的应用 10.4 KEGG在代谢组学中的应用
首页 教程 KEGG数据库 如何理解KEGG BRITE图
KEGG BRITE图是KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库中的一种图形表示方式,主要用于描述生物系统的层次结构和功能分类。在KEGG BRITE图中,不同的节点代表不同的分类级别,节点之间的连线表示了类别之间的包含关系。 理解KEGG BRITE图的关键在于理解其节点和边的含义: 1. 节点:每个节点代表一个分类级别,节点上的标签通常是该分类级别的名称或者缩写。节点的颜色也有特定的含义,例如红色通常代表分子,蓝色代表细胞组分,绿色代表器官等。 2. 边:边连接两个节点,表示了它们之间的包含关系。比如,如果一个节点A通过一条边连接到另一个节点B,那么可以理解为节点A是节点B的一个子类。 3. 层次结构:KEGG BRITE图是一种树状结构,最顶层的节点通常是最概括的分类,随着层级的深入,分类越来越具体。这种结构可以帮助我们更好地理解和组织生物系统的复杂性。 4. 功能分类:除了表示层次结构,KEGG BRITE图还可以用于表示功能分类。在这种情况下,节点通常代表某种功能,而边则表示了这些功能之间的关系。 总的来说,KEGG BRITE图提供了一种直观的方式来展示生物系统的层次结构和功能分类,这对于生物学研究者来说是非常有价值的工具。

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