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KEGG数据库

1 KEGG介绍 1.1 KEGG的历史和背景 1.2 KEGG的主要功能和应用领域 2 KEGG数据库概述 2.1 KEGG PATHWAY 2.2 KEGG BRITE 2.3 KEGG MODULE 2.4 KEGG DISEASE 2.5 KEGG DRUG 2.6 KEGG ENVIRON 3 KEGG PATHWAY分析 3.1 如何查询KEGG PATHWAY 3.2 如何理解KEGG PATHWAY图 3.3 如何进行KEGG PATHWAY富集分析 4 KEGG BRITE分析 4.1 如何查询KEGG BRITE 4.2 如何理解KEGG BRITE图 4.3 如何进行KEGG BRITE富集分析 5 KEGG MODULE分析 5.1 如何查询KEGG MODULE 5.2 如何理解KEGG MODULE图 5.3 如何进行KEGG MODULE富集分析 6 KEGG DISEASE分析 6.1 如何查询KEGG DISEASE 6.2 如何理解KEGG DISEASE图 6.3 如何进行KEGG DISEASE富集分析 7 KEGG DRUG分析 7.1 如何查询KEGG DRUG 7.2 如何理解KEGG DRUG图 7.3 如何进行KEGG DRUG富集分析 8 KEGG ENVIRON分析 8.1 如何查询KEGG ENVIRON 8.2 如何理解KEGG ENVIRON图 8.3 如何进行KEGG ENVIRON富集分析 9 KEGG与其他数据库的交互 9.1 如何将基因ID转换为KEGG ID 9.2 如何将KEGG ID转换为基因ID 9.3 如何将KEGG ID转换为Uniprot ID 9.4 如何将Uniprot ID转换为KEGG ID 10 KEGG在生物信息学中的应用 10.1 KEGG在基因组学中的应用 10.2 KEGG在转录组学中的应用 10.3 KEGG在蛋白质组学中的应用 10.4 KEGG在代谢组学中的应用
首页 教程 KEGG数据库 KEGG MODULE
KEGG MODULE是KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库中的一个模块,它提供了一种系统水平的理解生物功能和代谢通路的方法。每个MODULE都是由一组相关的KEGG PATHWAY组成,这些PATHWAY在功能上相互关联,共同完成一项特定的生物学任务。 KEGG MODULE包括了各种各样的生物学过程,比如碳水化合物代谢、能量代谢、氨基酸代谢、核苷酸代谢、信号转导、环境信息处理等。每个MODULE都有一个独特的标识符,例如M00001代表的是糖酵解途径。 KEGG MODULE的一个重要特点是它们包含了基因组信息。这意味着,对于已经测序的物种,我们可以知道哪些基因参与了某个特定的MODULE。这对于我们理解基因的功能,以及在不同环境条件下基因如何调控代谢通路具有重要的意义。 此外,KEGG MODULE还可以用来进行功能注释和比较基因组学研究。通过比较不同物种中相同MODULE的构成,我们可以了解这些物种在代谢上的相似性和差异性,这对于研究物种进化和生态适应具有重要的价值。 总的来说,KEGG MODULE是一个强大的工具,它可以帮助我们从系统水平上理解和解析生物体内的复杂代谢网络。

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