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KEGG数据库

1 KEGG介绍 1.1 KEGG的历史和背景 1.2 KEGG的主要功能和应用领域 2 KEGG数据库概述 2.1 KEGG PATHWAY 2.2 KEGG BRITE 2.3 KEGG MODULE 2.4 KEGG DISEASE 2.5 KEGG DRUG 2.6 KEGG ENVIRON 3 KEGG PATHWAY分析 3.1 如何查询KEGG PATHWAY 3.2 如何理解KEGG PATHWAY图 3.3 如何进行KEGG PATHWAY富集分析 4 KEGG BRITE分析 4.1 如何查询KEGG BRITE 4.2 如何理解KEGG BRITE图 4.3 如何进行KEGG BRITE富集分析 5 KEGG MODULE分析 5.1 如何查询KEGG MODULE 5.2 如何理解KEGG MODULE图 5.3 如何进行KEGG MODULE富集分析 6 KEGG DISEASE分析 6.1 如何查询KEGG DISEASE 6.2 如何理解KEGG DISEASE图 6.3 如何进行KEGG DISEASE富集分析 7 KEGG DRUG分析 7.1 如何查询KEGG DRUG 7.2 如何理解KEGG DRUG图 7.3 如何进行KEGG DRUG富集分析 8 KEGG ENVIRON分析 8.1 如何查询KEGG ENVIRON 8.2 如何理解KEGG ENVIRON图 8.3 如何进行KEGG ENVIRON富集分析 9 KEGG与其他数据库的交互 9.1 如何将基因ID转换为KEGG ID 9.2 如何将KEGG ID转换为基因ID 9.3 如何将KEGG ID转换为Uniprot ID 9.4 如何将Uniprot ID转换为KEGG ID 10 KEGG在生物信息学中的应用 10.1 KEGG在基因组学中的应用 10.2 KEGG在转录组学中的应用 10.3 KEGG在蛋白质组学中的应用 10.4 KEGG在代谢组学中的应用
首页 教程 KEGG数据库 KEGG BRITE
KEGG BRITE是KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库的一个子库,主要用于生物系统功能的分类和注释。它提供了一种以层次结构方式组织生物系统功能的方法,包括分子功能、细胞过程、生理系统和疾病等。 在KEGG BRITE中,每个节点代表一个特定的功能类别,这些类别按照其相关性被组织成一个树状结构。这种结构使得用户可以方便地浏览和理解复杂的生物系统功能。 具体来说,KEGG BRITE的层级结构如下: 1. 最顶层:根节点,代表整个生物系统。 2. 第二层:大类,如"代谢"、"遗传信息处理"、"环境信息处理"和"细胞过程"等。 3. 第三层:子类,如"糖酵解/糖异生"、"DNA复制"、"信号转导"和"细胞运动"等。 4. 第四层及以下:更具体的类别,如特定的酶、通路或基因等。 此外,KEGG BRITE还提供了与其它KEGG数据库的链接,例如KEGG PATHWAY和KEGG GENOME,使得用户可以从不同的角度来研究生物系统功能。 总的来说,KEGG BRITE是一个强大的工具,可以帮助研究人员更好地理解和解析复杂的生物系统功能。

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