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KEGG数据库

1 KEGG介绍 1.1 KEGG的历史和背景 1.2 KEGG的主要功能和应用领域 2 KEGG数据库概述 2.1 KEGG PATHWAY 2.2 KEGG BRITE 2.3 KEGG MODULE 2.4 KEGG DISEASE 2.5 KEGG DRUG 2.6 KEGG ENVIRON 3 KEGG PATHWAY分析 3.1 如何查询KEGG PATHWAY 3.2 如何理解KEGG PATHWAY图 3.3 如何进行KEGG PATHWAY富集分析 4 KEGG BRITE分析 4.1 如何查询KEGG BRITE 4.2 如何理解KEGG BRITE图 4.3 如何进行KEGG BRITE富集分析 5 KEGG MODULE分析 5.1 如何查询KEGG MODULE 5.2 如何理解KEGG MODULE图 5.3 如何进行KEGG MODULE富集分析 6 KEGG DISEASE分析 6.1 如何查询KEGG DISEASE 6.2 如何理解KEGG DISEASE图 6.3 如何进行KEGG DISEASE富集分析 7 KEGG DRUG分析 7.1 如何查询KEGG DRUG 7.2 如何理解KEGG DRUG图 7.3 如何进行KEGG DRUG富集分析 8 KEGG ENVIRON分析 8.1 如何查询KEGG ENVIRON 8.2 如何理解KEGG ENVIRON图 8.3 如何进行KEGG ENVIRON富集分析 9 KEGG与其他数据库的交互 9.1 如何将基因ID转换为KEGG ID 9.2 如何将KEGG ID转换为基因ID 9.3 如何将KEGG ID转换为Uniprot ID 9.4 如何将Uniprot ID转换为KEGG ID 10 KEGG在生物信息学中的应用 10.1 KEGG在基因组学中的应用 10.2 KEGG在转录组学中的应用 10.3 KEGG在蛋白质组学中的应用 10.4 KEGG在代谢组学中的应用
首页 教程 KEGG数据库 KEGG PATHWAY
KEGG PATHWAY是京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)中的一个数据库,它提供了一个系统性的、经过注释的 pathway 数据库。这个数据库收集了关于细胞内生化反应和遗传信息传递路径的信息,并将这些信息组织成一张相互连接的网络图。 在这个网络图中,每一个节点代表一个基因或者一个代谢物,每一条边代表两个节点之间的关系,可能是调控关系,也可能是生化反应。通过这种方式,KEGG PATHWAY可以帮助研究者理解细胞内的生物化学过程是如何协同工作的。 KEGG PATHWAY包括了许多不同的pathway,如代谢途径、遗传信息处理途径、环境信息处理途径以及细胞过程途径等。每一个pathway都包含了详细的描述和相关的参考文献,使得研究者可以深入了解该pathway的工作原理和相关研究进展。 此外,KEGG PATHWAY还提供了许多工具和接口,使得研究者可以根据自己的需求来查询和分析数据。例如,研究者可以通过输入一组基因或代谢物的名称,来查看它们在哪些pathway中起作用,或者查看哪些pathway可能受到这组基因或代谢物的影响。 总的来说,KEGG PATHWAY是一个非常有用的资源,对于理解和研究细胞内的生物化学过程有着重要的作用。

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