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KEGG数据库

1 KEGG介绍 1.1 KEGG的历史和背景 1.2 KEGG的主要功能和应用领域 2 KEGG数据库概述 2.1 KEGG PATHWAY 2.2 KEGG BRITE 2.3 KEGG MODULE 2.4 KEGG DISEASE 2.5 KEGG DRUG 2.6 KEGG ENVIRON 3 KEGG PATHWAY分析 3.1 如何查询KEGG PATHWAY 3.2 如何理解KEGG PATHWAY图 3.3 如何进行KEGG PATHWAY富集分析 4 KEGG BRITE分析 4.1 如何查询KEGG BRITE 4.2 如何理解KEGG BRITE图 4.3 如何进行KEGG BRITE富集分析 5 KEGG MODULE分析 5.1 如何查询KEGG MODULE 5.2 如何理解KEGG MODULE图 5.3 如何进行KEGG MODULE富集分析 6 KEGG DISEASE分析 6.1 如何查询KEGG DISEASE 6.2 如何理解KEGG DISEASE图 6.3 如何进行KEGG DISEASE富集分析 7 KEGG DRUG分析 7.1 如何查询KEGG DRUG 7.2 如何理解KEGG DRUG图 7.3 如何进行KEGG DRUG富集分析 8 KEGG ENVIRON分析 8.1 如何查询KEGG ENVIRON 8.2 如何理解KEGG ENVIRON图 8.3 如何进行KEGG ENVIRON富集分析 9 KEGG与其他数据库的交互 9.1 如何将基因ID转换为KEGG ID 9.2 如何将KEGG ID转换为基因ID 9.3 如何将KEGG ID转换为Uniprot ID 9.4 如何将Uniprot ID转换为KEGG ID 10 KEGG在生物信息学中的应用 10.1 KEGG在基因组学中的应用 10.2 KEGG在转录组学中的应用 10.3 KEGG在蛋白质组学中的应用 10.4 KEGG在代谢组学中的应用
首页 教程 KEGG数据库 KEGG在代谢组学中的应用
KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是一个综合性的生物信息学数据库,它包含了基因组、化学物质、代谢途径等多方面的信息。在代谢组学中,KEGG主要被用于以下几个方面: 1. 代谢通路分析:KEGG的代谢通路图是研究代谢组学的重要工具。通过将实验得到的代谢物数据映射到KEGG的代谢通路图上,可以直观地看到哪些代谢途径受到了影响,从而推断出可能的生物学过程和疾病状态。 2. 功能注释:KEGG提供了丰富的基因功能注释信息,包括基因的功能描述、参与的代谢途径等。这些信息可以帮助研究人员更好地理解代谢物的功能和作用机制。 3. 代谢物鉴定:KEGG的化合物数据库包含了大量已知的化学物质的信息,包括结构、性质、参与的代谢途径等。通过比对实验数据和KEGG的化合物数据库,可以鉴定未知代谢物的结构和性质。 4. 数据整合和挖掘:KEGG提供了多种工具和接口,支持多种数据格式的输入和输出,可以方便地与其他数据库和软件进行数据交换和整合。这使得KEGG在大规模数据分析和挖掘中具有重要的应用价值。 总的来说,KEGG在代谢组学中的应用主要包括了代谢通路分析、功能注释、代谢物鉴定和数据整合等多个方面,为代谢组学的研究提供了强大的支持。

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