KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是一个综合性的生物信息学数据库,旨在系统地分类和注释基因组、生物化学、细胞过程以及生物系统等生物学信息。它由日本京都大学的Kanehisa实验室于1995年创立。
KEGG的历史可以追溯到20世纪80年代末,当时Masahiro Kanehisa教授开始开发用于预测蛋白质功能的算法。这些早期的工作最终导致了KEGG在1995年的发布。从那时起,KEGG已经发展成为一个全面的数据库,包含了各种生物体的基因组信息,包括细菌、古菌、真核生物和病毒。
KEGG的核心理念是通过描绘代谢途径、信号转导通路和其他分子网络来理解生物系统的复杂性。为此,KEGG提供了多种工具和资源,包括KEGG PATHWAY、KEGG BRITE、KEGG MODULE等,以帮助研究人员解析基因组数据并理解生物过程。
此外,KEGG还提供了一种名为KEGG Orthology(KO)的系统,用于描述基因的功能相似性。这个系统基于一种称为“ortholog”的概念,即在不同物种中具有相同或相似功能的基因。通过这种方法,KEGG能够将来自不同物种的基因进行比较,并推断它们可能的功能。
总的来说,KEGG是一个强大的工具,对于理解基因功能、揭示生物过程以及研究疾病机制等方面都有着重要的作用。