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KEGG数据库

1 KEGG介绍 1.1 KEGG的历史和背景 1.2 KEGG的主要功能和应用领域 2 KEGG数据库概述 2.1 KEGG PATHWAY 2.2 KEGG BRITE 2.3 KEGG MODULE 2.4 KEGG DISEASE 2.5 KEGG DRUG 2.6 KEGG ENVIRON 3 KEGG PATHWAY分析 3.1 如何查询KEGG PATHWAY 3.2 如何理解KEGG PATHWAY图 3.3 如何进行KEGG PATHWAY富集分析 4 KEGG BRITE分析 4.1 如何查询KEGG BRITE 4.2 如何理解KEGG BRITE图 4.3 如何进行KEGG BRITE富集分析 5 KEGG MODULE分析 5.1 如何查询KEGG MODULE 5.2 如何理解KEGG MODULE图 5.3 如何进行KEGG MODULE富集分析 6 KEGG DISEASE分析 6.1 如何查询KEGG DISEASE 6.2 如何理解KEGG DISEASE图 6.3 如何进行KEGG DISEASE富集分析 7 KEGG DRUG分析 7.1 如何查询KEGG DRUG 7.2 如何理解KEGG DRUG图 7.3 如何进行KEGG DRUG富集分析 8 KEGG ENVIRON分析 8.1 如何查询KEGG ENVIRON 8.2 如何理解KEGG ENVIRON图 8.3 如何进行KEGG ENVIRON富集分析 9 KEGG与其他数据库的交互 9.1 如何将基因ID转换为KEGG ID 9.2 如何将KEGG ID转换为基因ID 9.3 如何将KEGG ID转换为Uniprot ID 9.4 如何将Uniprot ID转换为KEGG ID 10 KEGG在生物信息学中的应用 10.1 KEGG在基因组学中的应用 10.2 KEGG在转录组学中的应用 10.3 KEGG在蛋白质组学中的应用 10.4 KEGG在代谢组学中的应用
首页 教程 KEGG数据库 KEGG的历史和背景
KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是一个综合性的生物信息学数据库,旨在系统地分类和注释基因组、生物化学、细胞过程以及生物系统等生物学信息。它由日本京都大学的Kanehisa实验室于1995年创立。 KEGG的历史可以追溯到20世纪80年代末,当时Masahiro Kanehisa教授开始开发用于预测蛋白质功能的算法。这些早期的工作最终导致了KEGG在1995年的发布。从那时起,KEGG已经发展成为一个全面的数据库,包含了各种生物体的基因组信息,包括细菌、古菌、真核生物和病毒。 KEGG的核心理念是通过描绘代谢途径、信号转导通路和其他分子网络来理解生物系统的复杂性。为此,KEGG提供了多种工具和资源,包括KEGG PATHWAY、KEGG BRITE、KEGG MODULE等,以帮助研究人员解析基因组数据并理解生物过程。 此外,KEGG还提供了一种名为KEGG Orthology(KO)的系统,用于描述基因的功能相似性。这个系统基于一种称为“ortholog”的概念,即在不同物种中具有相同或相似功能的基因。通过这种方法,KEGG能够将来自不同物种的基因进行比较,并推断它们可能的功能。 总的来说,KEGG是一个强大的工具,对于理解基因功能、揭示生物过程以及研究疾病机制等方面都有着重要的作用。

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