NewMer-新建分析任务

分析：megahit组装[g/megahit]

帮助文档

2023-04-04

megahit用于宏基因组测序数据的组装。组装速度较快，消耗资源较低。

[ 文献引用：Li D , Liu C M , Luo R , et al. MEGAHIT: an ultra-fast single-node solution for large and complex metagenomics assembly via succinct de Bruijn graph[J]. Bioinformatics, 2015, 31(10):1674-1676. ]

运行环境

在线本地：无查看/配置环境

参数设置

任务名称

是否批量

fq1文件

选择文件文件预览上传临时文件粘贴内容

fq2文件

选择文件文件预览上传临时文件粘贴内容

min contig length

k-min

k-max

k setp

登录运行

环境

软件:

megahit 说明：示例：MEGAHIT-1.2.9-Linux-x86_64-static/bin/。示例：/path/MEGAHIT-1.2.9-Linux-x86_64-static/bin/

数据库:

其他:

通明学练数据挖掘 NGplot绘图 NewMer生信首页

关注我们获取最新动态和更多干货内容

微信公众号：NewMer生信小红书号：NewMer B站：Newmer生信抖音：NewMer生信知乎：NewMer生信客服微信号：z_gqing

木牛零码

木牛零码

分析：megahit组装[g/megahit]

运行环境

参数设置

环境