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分析：bowtie2比对[g/bowtie2]

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bowtie2先对参考序列建索引，然后比对生成sam文件，samtools软件再将sam转为bam文件
[ 文献引用：Langmead B , Salzberg S L . Fast gapped-read alignment with Bowtie 2[J]. Nature Methods, 2012, 9(4):357-359. ]

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