介绍
使用bcftools软件,对 vcf文件排序
输入
vcf文件
格式例如
#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT A
1 1000 . G A 1806 . DP=35;DP4=1,2,3,4;AN=2;AC=1 GT:GQ:DP:GL 0/1:409:35:-20,-5,-20
1 1001 . G A 1806 . DP=35;DP4=1,2,3,4;AN=2;AC=1 GT:GQ:DP:GL 0/1:409:35:-20,-5,-20
结果
排序后的vcf文件