介绍
统计序列数、碱基数、Large序列数、Large序列碱基数、最大长度、GC含量、N50、N90和N率等
输入
fasta序列文件:
格式例如,
>seqname1
AAAAAAAAGCTACTTGGAGTACCAATAATAAAGTGAGCCCACCTTCCTGGTACCCAGACATTTC
结果
生成序列统计表
All_Num : 序列数
All_Bases : 总碱基数
Large_Num : Large序列数
Large_Bases : Large序列的总碱基数
Largest_Bases : 最长序列碱基数
N50 : N50序列长度
N90 : N90序列长度
G+C : GC 含量
N_Rate : N率(位置碱基的含量)