介绍
Salmon不比对快速宏基因组基因定量
输入
1.参考序列索引: 用salmon index对参考序列构建索引的结果路径
2.fq1:左端的read序列文件
3.fq2:右端的read序列文件
结果
生成结果quant.sf,例如
Name Length EffectiveLength TPM NumReads
g1 256 36.763 9545.604194 5.000
g2 298 61.085 4595.839603 4.000
g3 299 61.650 5195.523516 4.564