木牛零码

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salmon建索引 帮助文档
1 介绍 2 输入 3 结果

介绍

salmon软件用于基因表达量或丰度的计算，需要先对参考序列建立索引。

输入

fasta文件：参考序列的fasta文件 例如， >seqname1 AAAAAAAAGCTACTTGGAGTACCAATAATAAAGTGAGCCCACCTTCCTGGTACCCAGACATTTC kmer: kmer长度值

结果

索引文件，用于后续分析
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