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介绍

使用viennarna软件的RNAfold工具预测RNA的二级结构

输入

rna序列文件: fasta格式,例如 >seqname1 AAAAAAAAGCTACTTGGAGTACCAATAATAAAGTGAGCCCACCTTCCTGGTACCCAGACATTTCAGGAGGTCGGGAAA

结果

输出的结构文件 out.str 例如, >tig00000462_pilon_pilon:585561-585672 GGCGGCGUCCUACUCUCCCACAGGGUCCCCCCUGCAGUACCAUCGGCGCUGAAAGGCUUAGCUUCCGGGUUCGGAAUGUAACCGGGCGUUUCCCUAACGCUAUAACCACCG (((((((((...........(((((....)))))..........)))))))...((.(((..(((((....)))))..))))).((((((.....))))))....)).... (-33.50)
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