介绍
RDA-CCA分析使用的是R语言的vegan包进行分析
输入
丰度文件：
制表符分割，一列是一个样本数据
例如
# a1 a2 a3 b1 b2 b3
var1 10 34 51 19 21 31
var2 22 21 41 89 78 79
var3 66 87 56 76 89 90
var4 18 37 46 55 54 63
var5 19 40 50 61 58 76
分组文件
例如
#sample group
a1 a
a2 a
a3 a
b1 b
b2 b
b3 b
环境因子表：
例如，
#SampleID P C N M
a1 252.61 1.14 1.09 0.55
a2 253.75 1.36 1.37 0.52
a3 251.07 1.14 1.09 0.55
b1 209.97 0.61 0.72 0.44
b2 221.81 1.25 1.37 0.48
b3 231.59 0.51 0.46 0.57
指定一列环境因子：
环境因子表中可能有多个环境因子，需指定一个环境因子进行分析。
例如指定， P
结果
*_importance.xls 解释度
例如
Axes Proportion of Variance
RDA1 0.602687201676716
RDA2 0.280636221166338
RDA3 0.0915133751202424
RDA4 0.023756133848486
RDA5 0.00140706818821763
*sites.xls
例如
Sample_ID RDA1 RDA2 RDA3 RDA4 RDA5
*biplot.xls
例如
Environment RDA1 RDA2 RDA3 RDA4 RDA5
P -1 0 0 0 0
