介绍
NMDS分析采用降维的思想对样本关系进行低维平面的、样本距离矩阵的投影。
使用的程序是R语言的vegan、ade4包
输入
距离文件：
例如
# a1 a2 a3 b1 b2 b3
a1 10 34 51 19 21 31
a2 22 21 41 89 78 79
a3 66 87 56 76 89 90
b1 18 37 46 55 54 63
b2 19 40 50 61 58 76
b3 39 88 88 80 34 39
分组文件：
例如，
#sample group
a1 a
a2 a
a3 a
b1 b
b2 b
b3 b
结果
nmds_sites.xls
例如，
Sample_ID MDS1 MDS2
a1 -6.52873776345856 -10.532740779081
a2 -32.0778419239557 -28.0856952034466
a3 -2.03251671057432 52.6725620029463
b1 -34.6510360665558 2.34836875444998
b2 23.4689604780897 -2.42428291864348
b3 51.8211719864547 -13.9782118562252
