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介绍

kmeans聚类大致过程 1.假定对N个样本观测做聚类,要求聚为K类,首先选择K个点作为初始中心点; 2.按照距离初始中心点最小的原则,把所有观测分到各中心点所在的类中; 3.每类中有若干个观测,计算K个类中所有样本点的均值,作为第二次迭代的K个中心点; 4.然后根据这个中心重复第2、3步,直到收敛(中心点不再改变或达到指定的迭代次数),聚类过程结束 采用的程序是python的sklearn.cluster.KMeans 详见: http://scikit-learn.org/stable/modules/generated/sklearn.cluster.KMeans.html

输入

表格文件: 矩阵表格 例如 #OTU_ID C1 C2 C3 C4 C5 C6 var0 77 14 89 64 52 50 var1 7 31 38 55 60 30 var2 29 41 94 64 49 9 ...... 聚类数: 得到的类的个数
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