介绍
使用kallisto软件建索引并计算表达量
输入
fasta文件：
拼接组装后的fasta文件
格式例如
>seqname1
AAAAAAAAGCTACTTGGAGTACCAATAATAAAGTGAGCCCACCTTCCTGGTACCCAGACATTTC
>seqname2
GGAGTACCAATAATAAAGTGAGCCCACCTTCCTGGTACCCAGAC
fq1,fq2 文件： 左右端reads数据，fastq格式
结果
abundance.tsv 结果文件
例如
target_id length eff_length est_counts tpm
TRINITY_DN1_c0_g1_i1 256 37.4003 5 9463.28
TRINITY_DN3_c0_g1_i1 298 62.2018 4 4552.01
TRINITY_DN5_c0_g1_i1 299 62.551 4.70209 5321.12
TRINITY_DN5_c0_g2_i1 260 39.7381 9.29791 16562.4
