介绍
插入序列(IS)是原核基因组中最小但最丰富的可移动元件
ISEScan用于原核生物基因组中的IS元件的鉴定
输入
基因组序列:
fasta格式,例如
>tig00000462_pilon_pilon
CCAGCACCGGGTGGCCGTTGCGCCGCGCGTCCGACAGCCGCTCCAGCAGCAGCATGCCCACACCCTCGCCCCAGCCCGTG
CCGTCCGCGGCGGCCGCGAACGCCTTGCACCGGCCGTCCGGCGCGAGACCCCGCTGACGGCTGAACTCCACGAAGAGGCC
GGGCGTGGACATCACGGTCACGCCACCGGCGAGGGCGAGCGGGCACTCCCCCTGCCGCAGGGACTGCACCGCGAGATGCA
GTGCCACCAGCGACGACGAGCAGGCGGTGTCCACCGTCACCGCGGGCCCCTCGAAGCCGAAGGTGTAGGAGAGCCGACCC
GACATGACGCTGGCCGCGCCGCTGGT...
结果
结果表格文件
例如
>tig00000462_pilon_pilon
1 38904 - 2 1.213472 I:942,38813, D:
38989 40625 - 1 1.194179 I: D:40057,
40644 40814 + 3 1.324823 I: D:
40848 41092 + 3 1.372382 I: D:41080,
41221 42474 - 1 1.216103 I: D:
42729 45808 + 3 1.183207 I: D:44266,