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介绍

插入序列(IS)是原核基因组中最小但最丰富的可移动元件 ISEScan用于原核生物基因组中的IS元件的鉴定

输入

基因组序列: fasta格式,例如 >tig00000462_pilon_pilon CCAGCACCGGGTGGCCGTTGCGCCGCGCGTCCGACAGCCGCTCCAGCAGCAGCATGCCCACACCCTCGCCCCAGCCCGTG CCGTCCGCGGCGGCCGCGAACGCCTTGCACCGGCCGTCCGGCGCGAGACCCCGCTGACGGCTGAACTCCACGAAGAGGCC GGGCGTGGACATCACGGTCACGCCACCGGCGAGGGCGAGCGGGCACTCCCCCTGCCGCAGGGACTGCACCGCGAGATGCA GTGCCACCAGCGACGACGAGCAGGCGGTGTCCACCGTCACCGCGGGCCCCTCGAAGCCGAAGGTGTAGGAGAGCCGACCC GACATGACGCTGGCCGCGCCGCTGGT...

结果

结果表格文件 例如 >tig00000462_pilon_pilon 1 38904 - 2 1.213472 I:942,38813, D: 38989 40625 - 1 1.194179 I: D:40057, 40644 40814 + 3 1.324823 I: D: 40848 41092 + 3 1.372382 I: D:41080, 41221 42474 - 1 1.216103 I: D: 42729 45808 + 3 1.183207 I: D:44266,
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