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介绍

glimmer基因预测软件生成的的结果是表格形式,包含基因在长序列中的位置信息, 根据该表和预测用的长序列,提取基因的核酸序列

输入

glimmer软件基因的预测结果表: 例如 >scaffold4 orf00016 38720 921 -3 9.23 orf00017 40056 38989 -1 14.86 orf00018 40943 40053 -3 9.98 orf00019 42474 41221 -1 14.08 orf00021 42729 44270 +3 14.36 orf00023 44267 45808 +2 14.79 orf00024 46153 47928 +1 10.51 orf00027 48923 47940 -3 12.72 预测用的长序列文件(fasta格式) 例如 >scaffold4 AAAAAAAAGCTACTTGGAGTACCAATAATAAAGTGAGCCCACCTTCCTGGTACCCAGACATTTCAGGAGGTCGGGAAA..... >scaffold3 TGGAGTACCAATAATAAAGTGAGCCCACCTTCCTGGTACCCAGACATTTCGAGTACCAATAATAAAGTGA......

结果

基因的核酸序列文件(fasta格式)
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