介绍
使用glimmer预测微生物DNA中的基因(特别是细菌、古菌和病毒)。
输入
基因组序列(fasta格式)
例如
>scaffold1
AAAAAAAAGCTACTTGGAGTACCAATAATAAAGTGAGCCCACCTTCCTGGTACCCAGACATTTC...
>scaffold2
GGAGTACCAATAATAAAGTGAGCCCACCTTCCTGGTACCCAGAC...
结果
预测的表格文件
例如:
>scaffold2
orf00016 38720 921 -3 9.23
orf00017 40056 38989 -1 14.86
orf00018 40943 40053 -3 9.98
orf00019 42474 41221 -1 14.08
orf00021 42729 44270 +3 14.36
orf00023 44267 45808 +2 14.79
orf00024 46153 47928 +1 10.51
orf00027 48923 47940 -3 12.72