介绍
组装序列存在Gap，Gapcloser可基于reads 填充Gap，使组装结果更完整。
gapcloser常用于Soapdenovo2软件组装后的Gap填充。
输入
fasta文件： 组装后得到的序列
例如，
>seqname
AAAAAAAAGCTACTTGGAGTACCAATAATAAAGTGAGCCCACCTTCCTGGTACCCAGACATTTC
fastq1文件：
左端reads的fastq格式文件
fastq2文件：
右端reads的fastq格式文件
fastq文件格式，例如
@NS500713:64:HFKJJBGXY:1:11101:1675:1101 1:N:0:TATAGCCT+GACCCCCA
AAAAAAAAGCTACTTGGAGTACCAATAATAAAGTGAGCCCACCTTCCTGGTACCCAGACATTTCAGGAGGTCGGGAAA
+
6AAAAAEEEEE/E/EA/E/AEA6EE//AEE66/AAE//EEE/E//E/AA/EEE/A/AEE/EEA//EEEEEEEE6EEAA
reads length： read的最大长度，任何比它大的read会被切到这个长度，该值一般设置的比实际read读长稍微短一些
insert length： 文库的平均插入长度
结果
新的fasta文件
