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介绍

FastQC软件用于二代测序数据质量的评估,能快速对测序数据进行检测,并生成详细的质量评估报告

输入

fastq文件夹: 文件夹下fastq文件的格式,要以fq或fastq或fastq.gz为后缀。将对fastq文件下以这些为后缀的文件 数据做质量评估

结果

1.对整个测序文件中的读长数据进行质量评估 (二代测序,在每一个读长末端出现质量评分一定程度的降低是正常现象) 2.统计每个序列质量评分 3.序列碱基含量 4.序列GC含量 5.碱基N含量
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