介绍
根据序列名称列表,从总序列文件中提取序列
输入
总的序列文件(fasta格式)
例如
>scaffold1
GTACCAATAATAAAGTGAGCCCACCTTCCTGGTACCCAGACATTTCAGGAGGTCGGGAAA
>scaffold2
TGGAGTACCAATAATAAAGTGAGCCCACCTT
>scaffold3
CCTGGTACCCAGACATTTCGAGTACCAATAATAAAGTGA
>scaffold4
AAAAAAAAGCTACTTGGAGTACCAATAATAAA
需提取的序列名称列表文件:
例如
scaffold2
scaffold4
结果
提取出的序列文件
例如
>scaffold2
TGGAGTACCAATAATAAAGTGAGCCCACCTT
>scaffold4
AAAAAAAAGCTACTTGGAGTACCAATAATAAA