介绍
使用的是python的scipy模块计算欧式距离
输入
输入的文件
例如:
#OTU_ID C1 C2 C3 C4 N1 N2 N3 N4 S1 S2 S3 S4
var0 77 14 89 64 30 15 31 3 21 13 14 62
var1 7 31 38 55 80 96 16 83 53 79 79 50
var2 29 41 94 64 80 73 48 19 16 24 39 54
var3 11 87 63 66 94 36 36 13 41 34 44 55
var4 41 79 45 60 25 32 63 83 75 22 69 37
结果
欧式距离矩阵表
格式例如:
C1 C2 C3
C1 0.01 0.035 0.316
C2 0.035 0.06 0.523
C3 0.316 0.523 0.04