介绍
使用的是R的car包计算置信椭圆的坐标
输入
数据表:
例如
Sample_ID PC1 PC2
a1 -53.3158253786436 20.1097825573183
a2 -32.6758839166003 -7.56931372418045
a3 -14.5188276424877 -27.9604243148421
b1 34.3941955199972 11.121861820717
b2 26.5019102588601 10.2124503187444
b3 39.6144311588742 -5.91435665775718
分组表:
例如
#sample group
a1 a
a2 a
a3 a
b1 b
b2 b
b3 b
结果
生成置信椭圆的坐标文件
例如
PC group m1 c11 c12 m2 c21 c22
PC1_PC2 a -33.5035 -82.2525 4.14726 -5.1399 102.3622 0
PC1_PC2 b 33.50351 -21.6333 17.7884 5.1399 40.66203 0