介绍
dbRDA是一种基于距离的冗余分析方法，可用于分析环境因子对微生物群落结构和功能的影响。
使用的是R语言的vegan包
输入
丰度文件：
例如，
# a1 a2 a3 b1 b2 b3
var1 10 34 51 19 21 31
var2 22 21 41 89 78 79
var3 66 87 56 76 89 90
var4 18 37 46 55 54 63
var5 19 40 50 61 58 76
环境因子表
例如，
#SampleID P C N M
a1 252.61 1.14 1.09 0.55
a2 253.75 1.36 1.37 0.52
a3 251.07 1.14 1.09 0.55
b1 209.97 0.61 0.72 0.44
b2 221.81 1.25 1.37 0.48
b3 231.59 0.51 0.46 0.57
结果
sites.xls
例如，
CAP1 CAP2
a1 -5.97523106406323 -2.67127646548796
a2 -3.98388962736233 6.64986377390916
a3 -2.18739244036519 -4.44414371413197
b1 4.24822772297132 -4.0607823344414
b2 3.3040655672617 1.27868602358378
b3 4.59421984155774 3.2476527165684
cont.xls
例如，
CAP1 CAP2 CAP3 CAP4 MDS1
Eigenvalue 1396.06521263371 161.610529594583 37.8906088918083 1.28259505044525 387.451053829451
Proportion Explained 0.703555517126297 0.0814446049461187 0.0190952017798762 0.000646371541825957 0.195258304605882
Cumulative Proportion 0.703555517126297 0.785000122072416 0.804095323852292 0.804741695394118 1
biplot.xls
例如，
CAP1 CAP2
P -4.86101856246027 1.02068904430562
C -3.78743799820471 1.14435693246106
N -3.03295163550894 1.09192963508733
M -2.32307252484514 1.06159649525984
db_rda.pdf
