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介绍

使用cd-hit软件,去fasta文件的冗余序列

输入

Fasta序列文件: 例如 >seqname1 AAAAAAAAGCTACTTGGAGTACCAATAATAAAGTGAGCCCACCTTCCTGGTACCCAGACATTTC >seqname2 GGAGTACCAATAATAAAGTGAGCCCACCTTCCTGGTACCCAGAC identity: sequence identity threshold, default 0.9

结果

去冗余后的新的fasta序列文件
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