多组差异

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2025-01-13

相关性聚类环形热图

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2024-12-02

宏基因组流程

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2023-05-22

流程包括fastp质控、megahit组装、基因预测(metagene)、去冗余序列得到非冗余基因集、salmon定量、基因注释、物种注释等

分组统计通用分析流程

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2023-05-21

包括：差异检验、PCA、PCOA、NMDS、adonis分析、相关性分析、聚类

qiime2工作流

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2023-05-20

流程包括：PE原始数据生成qza、dada2 (paired)、alpha指数、vsearch分类等

二代测序数据组装筛选

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2023-05-20

流程包括质控、不同soapdenovo2参数的组装、并统计各个组装序列信息并汇总。可根据组装信息汇总表选择合适的组装结果

细菌二代测序质控组装流程

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2023-05-18

流程包括fastp质控、soapdenovo2组装、组装序列补Gap、组装统计

细菌基因组标准分析

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2023-05-18

基因预测、trna分析、rrna分析、重复序列和注释等

转录组流程

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2023-04-17

流程包括：fastqc测序原始数据、fastp质控、hisat2比对、stringtie拼接、kallisto定量等

细菌基因组结构预测2

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2023-03-31

分析包括前噬菌体、整合子、基因组岛、插入序列、crisprs