生信分析

- 产品介绍 -

[细菌]

原始数据质控 基因组评估 组装

重复序列分析 启动子分析 旁系同源基因 可移动元件 基因组图谱 基因组圈图

编码基因预测 tRNA预测 rRNA预测

nr数据库注释 Swiss-Prot注释 Pfam注释 COG注释 GO注释 KEGG注释

CAZy注释 次级代谢产物

毒力基因 耐药基因 PHI基因 分泌系统分析 分泌蛋白分析 转运蛋白分析 跨膜蛋白

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[比较基因组]

同源基因分析 泛基因组分析

物种树 基因树 ANI分析 AAI分析

基因组共线性分析

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[Binning]

Bin组装 物种鉴定

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[多样性]

数据质控 OTU

Rank-Abundance曲线 Pan/Core物种分析 多样性指数 指数组间差异 稀释曲线分析

物种差异分析 Lefse多级物种差异

PCA PCOA NMDS ANOSIM Adonis PLS-DA

VIF方差膨胀因子 RDA/CCA db-RDA分析 相关性Heatmap 排序回归 VPA方差分解

PICRUST功能预测

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[宏基因组]

宏基因组数据质控 宏基因组组装 宏基因组基因预测

非冗余基因集 功能注释

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[代谢]

表达量数据预处理 KEGG化合物分类 HMDB化合物分类

PCA分析 PLS-DA分析 普氏分析 KEGG功能富集

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[真核/原核的有参/无参转录组]

原始数据质控 测序饱和度 转录组从头组装 转录本有参组装 组装结果评估

转录组功能注释(NR,Swiss-prot,pfam,COG,GO, KEGG)

转录因子分析 转录因子家族

表达量计算 表达量相关性分析 表达量PCA分析 表达量差异分析

SNP/Indel分析分析 CDS预测 SSR分析

可变剪切 蛋白互作网络 iPath分析

sRNA预测 sRNA注释 sRNA二级结构预测 sRNA靶基因预测

操纵子分析 UTR预测 启动子预测

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[lncRNA]

已知lncRNA鉴定 新lncRNA预测 lncRNA靶基因分析 lncRNA家族分析 micRNA前体预测

lncRNA序列保守性分析 lncRNA位点保守性分析

表达量分析 表达量差异分析

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[smallRNA]

已知miRNA分析 ncRNA分析 新miRNA预测 miRNA碱基偏好性分析 miRNA家族分析

miRNA靶基因分析 靶基因功能注释 靶基因功能富集 靶基因蛋白互作

表达量分析 表达量差异分析

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[全转录组]

测序数据质控 转录本组装

miRNA鉴定和预测 lncRNA鉴定和预测 circRNA鉴定

表达量分析 表达量差异分析

miRNA靶基因预测 lncRNA靶基因预测

基因功能注释 基因功能富集分析 表达相关性分析

可变剪切分析 SNP/Indel分析 miRNA结构分析 lncRNA结构分析

转录因子分析 蛋白互作网络

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- 定价 -

50元~2000元

具体价格根据实际情况而定,欢迎咨询

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